凡例正文经义脉要针灸歌诀手法总论摸法接法端法提法按摩法推拿法器具总论裹帘振梃披肩攀索迭砖通木腰柱竹帘杉篱抱膝接骨歌诀上歌诀方法总论内证出血泛注发热外邪昏愦眩晕烦躁发喘作呕口渴不食秘结瘀滞血虚作痛筋挛骨
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
伤寒心境别集
简介序卷一卷二卷三卷四
序论痘疹受病之由论痘疹治法类集痘疹已效名方附方附：
尚论篇
简介引言卷之一卷之二卷之三卷之四
简介自序东洞先生著述书日记卷上卷中卷下跋《药征续编》序卷上卷下《药征续编》附录《药征续编》附言十七则
自叙第一册·诸中门卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶五绝第一册·诸伤门伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳第一册·寒热门发热潮热恶寒往来寒热外热内寒外寒内热上热下寒上寒下热疟厥第二册·诸气门诸气郁痞水
第1部分第2部分第3部分